Mikroregion Černilovsko vznikl 28. 9. 1999 nejprve jako volné sdružení obcí bez právní subjektivity.
Po vzniku nového zákona o obcích se k 11. 4. 2002 transformoval na svazek obcí.
Hranice Mikroregionu přirozeně vyplynuly z území bývalé střediskové obce, která plnila svou funkci do roku 1990.
Patří sem obec Černilov včetně částí Bukovina a Újezd, dále obce Divec, Lejšovka, Libníkovice včetně částí Borovice a Horní Černilov, Librantice, Libřice a Výrava včetně části Dolní Černilov.