Mikroregion Černilovsko vznikl 28. 9. 1999 nejprve jako volné sdružení obcí bez právní subjektivity. Po vzniku nového zákona o obcích se k 11. 4. 2002 transformoval na svazek obcí. Hranice Mikroregionu přirozeně vyplynuly z území bývalé střediskové obce, která plnila svou funkci do roku 1990.
Mikroregion tvoří obec Černilov včetně částí obce Bukovina a Újezd, dále obce Divec, Lejšovka, Libníkovice včetně částí Borovice a Horní Černilov, Librantice, Libřice a Výrava včetně části Dolní Černilov. I přes osamostatnění jednotlivých obcí po roce 1990 zůstává společné školství, zdravotnictví, požární ochrana, matrika, stavební úřad aj. V roce 2003 ze svazku obcí vystoupil Divec, který se po několika letech opět připojil. V roce 2004 přistoupily obce Skalice a Smržov s jejich částmi Číbuz, Skalička a Hubíles.